工程保函是依据商务合同开出的，但又不依附于商务合同，是具有独立法律效力的法律文件。当受益人在保函项下合理索赔时，担保人就必须承担付款责任，而不论申请人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实，即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
投标保函
保证人在投标人投标之前，对投标人进行严格的资格审查，向招标人出具投标保函，保证投标人按照招标文件的规定参加招标活动，并在中标后及时与招标人签订工程合同，提供招标人所要求的履约、预付款等的保函。如果投标人违约，则保证人将在保额内赔付招标人的损失。
预付款保函
预付款保证担保是指由保证人为施工方向业主提供的，保证人对施工方履行扣还预付款义务的保证。以防止施工方在收到业主的预付款后将款项挪作他用或宣布破产等。当施工方在规定的时间内还清预付款项后，业主就需退还预付款保函。
履约分包保函
当工程存在总包分包关系时，总承包商要为各分包商的工作承担连带责任。总承包商为了保护自身的权益不受损害，往往要求分包商通过担保人为其提供担保，以防止分包商违约或负债。