预付款保函办理流程
1、保函申请
a、申请人填写开立保函申请书或开立保函合同;
b、申请人提交保证金或其他反担保;
c、申请人提交合同相关的基础材料;
d、申请人提交银行要求的其他相关开立保函所必需的材料。
2、保函审核及开出
a、银行对客户资格、基础交易、相关材料进行审查;
b、银行对客户的保证金或授信额度等抵押情况进行落实;
c、银行审核保函的书面申请及保函格式;
d、保函开出。
国家出口贸易为了使交易时更加放心有保障，都会要求对方开具一份预付款保函，这样既可避免交易中爽约的损失，在任何银行开具预付款保函的企业，首先是银行的开户会员，然后都必须是合法的企业有相关的营业执照等合法文件、有足够的业务资质等等，然后就可以在银行申请预付款保函，审核通过后就可以开出了。
预付款保函如何办理（担保公司保函办理的流程）一、委托人向担保公司提供相关基本资料；
（1） 公司营业执（三证合一的）；
（2） 企业资质证书；
（3） 招标文件（可提供电子版）；
（4） 中标通知书
（5） 施工合同（封面、协议部分）；
注：（资料1-6项适用于民工工资保函；资料1-4项适用于履约保函、业主支付保函；资料1-5项适用于预付款保函）
二、签订委托担保保证合同。
三、缴纳担保费。
四、出具保函。
五、定期做保后管理。
预付款保函主要分为工程履约保函和采购履约保函，
收费由担保费 和可能存在的保证金 两部分组成。
1）按照合同或招标文件中标书准备资料
2）了解反担保保证金比例以及相关费用
3）签订担保合同及申请书、董事会（或股东会）决议等资料
4）等待出函
1、保证金存入担保公司账户，在保函有效期内不可取出的保证金。
因为工程公司有住建部颁发建筑施工资质，能够大致判断申请公司的施工能力，担保公司对工程项目办理履约保函有分类：比如，一级资质免保证金办理保函，无资质需要预存10%-20%的保证金。
而供货类项目没有相关资质能够作证申请公司的经营能力，所以供货类项目很少免保证金办理预付款保函，一般需要预存5-30%的保证金。
2、 担保费，即办理保函的手续费。
办理预付款保函时，影响收费的因素有很多。需要了解：是工程项目，还是供货项目；是工程项目，资质是几级，要求什么格式等。
具体的收费，还是要根据项目的具体情况而定。
办理保函怎么收费？
不同银行的保函、保函金额、开具时间、对保函有无格式要求、项目的风险度、公司有无不良记录等都决定着怎么收您费用的。投标保函一般提供：招标文件、电子版营业执照，就可以给您报价，费用大概在0.1%-0.2%左右，具体要看您提供的资料来确定。
履约保函要提供的资料就多了，有招标文件、中标通知书、资质证书、保函金额、时间等，费用大概在1.5%-5%左右，履约的周期长，所以收费相比投标保函要高，具体的费用就需要您提供资料，公司的风控部门要对您的资料进行审核，然后才能给出准确的报价。
其他的保函，大同小异，都是需要先提供资料，然后才能给出报价，如果电话里就想得到一个报价，那是不现实的，打个电话，告知金额、时间，说实在的，你的项目能不能通过银行的审批都是一个未知数，别说给您报价了，先谈项目，在谈钱，这是正解。